Maxfilterメモ（２）：bad channels identification (2)

cはcontinuousのcだったようですね，ということで，

もしcHPIを取ってなかった場合，不良チャネル探索は，Step2と同時に行うことができる

ようです．また，

-autobad 20 よりもむしろ，-autobad 1を使う事は，記録中の一秒毎のバッドチャンネルのチェックになるかもしれず，データのはじめの20秒を基盤とした永続的な不良の宣言よりもよいかもしれない

とされています．（ということは，autobadは20秒「間」のチェックをする，ということではなく，20秒「毎」にチェックする（だからスキップがある）ということなんですね）．

autobadは，トリガーチャネルがゼロの値を持っているデータセグメントのみで働くことも特筆すべき

とありますが，ということは，データ計測時に，トリガをたてる（実験を開始する）前に意図的に20秒ほどのwaitを設定したほうが良いかもしれないということですね．まあ，HPI　measureの期間に20秒くらいは経過する気がしますが…

もし，データの相当の部分が，トリガチャネルのゼロでない値であれば，SSSの時間的拡張が，より明瞭なセンサーアーティファクトの除去を提供するかもしれない

ということで，SSSに行きましょう！

以下はあまり意味が良くわかってませんが，適当に解説．

不良チャネルのためのログファイルを通して，サーチを行う場合については，以下のコマンド．

cat <bad_chans_log_file> | sed -n /Static/p | cut -f 5- -d| tee <bad_chans_log.txt>

を利用する．catというのは，concatnateの略だったと思いますが，log fileの中身をテクストで表示するコマンドですね．sedはstream editorの略で，sed /aaa/bbbで，aaaをbbbに置き換えるコマンドです．つまり，出力されたlog file中の，Staticという部分をpに変更するということ（たぶん）．-nについては，これがないと全ての行を表示してしまうんだけど，-nオプションがあると，置換した行だけを表示してくれる，ということ（だったと思います）．cutについては，-fオプションをつけると，指定したフィールドを出力する（デフォルトのフィールド区切りはTAB)，ということで，-dオプションというのは，区切り文字に文字列(string)を利用する，というもの．つまり，５つ目のTAB区切りから，以降を区切り文字を用いて区分する，ということ？で，それを>bad_chans_log_txt<という名前のファイルで書き出すということですね（tee；前回記事参照）.ようするに，logファイルを，（以降扱いやすいような）txt形式に変更する，ということなんですかね…？

あとは，

自分の不良チャネルのためのraw dataの全てを，EEGLABデータブラウザをスキャンするために用いるとすれば，MNE_browse_rawを用いることができる．

ということですが，MNEって本当何してるか良くわかってないんですよね…．勉強します．とりあえず，1st stepはこのあたりで．