optseq2 memo

Event-related functional MRIを撮像する場合に，SOA/ISIを決定することは非常に重要です．渡辺の理解が正しければ，ある刺激が提示された後に，脳血流の増大が生じるはずですが，MRIではたとえばスライスあたり3秒間に１回しか撮像できません．そして，この血流増大が刺激に対して毎回同時刻に生じるとすれば，SOA/ISIを完全に固定すると，血流増大の関数の同じポイントでしか撮像できませんよ，ということになるのだと思います．更に，まだ前の刺激提示による血流増大が終わっていないときに，次の刺激が提示されてしまうと，正しい関数を作成できないことになる，という話なんだと理解しています．このあたりは非常にあやふやなので，ちゃんと勉強する予定ですが，ともあれ，このような問題を回避するためのソフトウェアを，Harvard大学が開発しておりまして，それがoptseq (optimal sequenceの略のようです）2，ということになります．細かいことは多分，本家を見ていただいた方が早いでしょう．こちらです．

さて，それじゃあoptseqを使ってみようということで，MacOSX:-Inter version of optseq2のリンクからダウンロードしてみたところ，標準テキストとしてダウンロードされて，開くを選択してもひらきゃしねえ，ということでしばらく悩んでいたのですが，とりあえず次のようにして解決しました．

まず，ftpクライアントをダウンロードする．渡辺はCyberduckを使いました．これで，ftp:/・surfer.nmr.mgh.harvard.eduに接続して，pub>optseq>MacOS>Inter>optseq2を選択してダウンロードすると，Unix実行ファイルとしてのoptseq2をダウンロードできます．これを開いてみると，ターミナルが開き，$(=optseq2があるフォルダ）/optseq2 ; exit;というコマンドが勝手に入力されて，optseq2の中身が出て，勝手にログアウトします．笑．

しかし，これで使い方が分かったので，ターミナルから，（フルパスで，たとえば渡辺だと，）Users/username/downloads/optseq2 などと入力すると，optseq2の中身を見ることが可能になります．（標準テキストの状態で，こうできるかどうかは良くわかりません）．これでようやく使える，ということですね．しつこいようですが，文系はここまで書いていただかないとわかんねーんですよ！頼みますよ！と吠えていてもアレなので，自分で書きました．再度まとめますと，

• optseq2の実体（？）は，UNIX実行ファイルで，コンソールから開くということ
• もし単純にダウンロードできないようなら，FTP転送を試して下さい，ということ
• コンソールから開く場合，フルパスを指定しなければいけませんよ，ということ（パスの追加をどーしたらいいか，というのが，winと違うので良くわからないよ）．

この3点をやれば，とりあえず「使える」ということになります．このくらい書いといてくださいよー，ということなんですけどね．近いうちに，具体的な使い方を多分書く事になると思います．というわけでカテゴリーを作ってみました（セルフプレッシャー）．