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本家(FCdonders)のtutorialは,VSM Medtecqから出ている,CTF Omega systemというものを対象としておりまして,neuromagを使っているものとしてはちょっとずれがあって,かつあまりmatlabに詳しくないと,「そこを説明してくれよ!」というところが無かったりして,大変苦労しますよね.と勝手に共感してしまいましたが,別にそんなことが無ければ申し訳ありません.

まず,環境ですが,matlab2007b(7.5) on Windows XPでは問題なく動いているようなのですが,何故かmatlab2009a on Mac OSX Leopard, matlab2007(a?b?) on Linuxでは挙動がおかしい部分があるようです.原因はわかりません….matlabに詳しい友達が欲しいですね.特に,read_dataで異常が発生しているようです.

幸いにもmatlab2007b on Windows XPユーザでありましたら,FieldTripの他に,MNEソフトウェアのダウンロードが必要です.以前の記事でも書きましたが,MNE softwareのページからどうぞ(メールアドレスの登録が必要です).matlabtoolboxのみのダウンロードで大丈夫でしょう.環境変数にMNE_ROOTを設定し,mne_setup_toolbox.mを(既にパスが通っている)Fieldtrip toolbox等にコピーしてから実行せよ,とありますが,これ,どうも単にパスを通すだけのmファイルのようなので,自分でパスを通せば問題なく使えそうです(今のところ).環境変数にMNE_ROOTを設定しろ,というからしたんですが,どうもあまりうまくない模様.なぜだろう.

とりあえずDefinetrialまではできてるんで,そこまでご説明します.先日書いたばっかりなのでアレですが,記事が長いのでかいつまみます.まず

evt = read_event ('filename.fif');
とします.ここで選択するfifファイルは,rawデータのほうですね.それで,ワークスペースからevt変数の中身をみてみると,1×1stringというセルが並んでいるはずなので,適当なところをクリックします.そうすると,type:'STI 014'(多分これは変わらないはず) value:1 (トリガ番号)等と書かれているはずなので,それを以下に書きます.注意点としては,valueで示されるトリガ番号は,10進法で解釈されるようですので,00000001, 00000010, 00000100,等のトリガを出力している場合は,1,2,4となりますね.
cfg = []; %なんか入ってると,そのデータで解釈されるので,一回年のためcfgを空にしておきますよ,ということ
cfg.dataset = 'filename.fif'; %filenameは保存した名前(-.fif)ですね.シングルクオーテーションをお忘れなく.また,rawデータを使います.
cfg.trialdef.eventtype = 'STI 014'; %CTFだとbackpanel triggerという名前のようですが,neuromagは多分STI 014です.半角スペースやシングルクオーテーションをお忘れなく!
cfg.trialdef.eventvalue = 1; %とりあえず今分析をしたい条件に与えていたトリガ番号を書きます.
cfg.trialdef.prestim = 1; %なくても動きます.イベントの定義区間を,トリガの[数字]秒前にします.
cfg.trialdef.prestim = 1; %なくても(略)[数字]秒後にします.
で大丈夫のはずです.ここまで設定すれば,あとはいよいよ,
cfg = definetrial(cfg);
で,matlabがちゃんと動くはずです.あとは,基本的にはcfgそのものを弄るだけっぽい(もともとfiffファイルに入っていたデータを確認する必要は多分あんまりない?)ので,本家のチュートリアルに従えばできそうだと思います.大変ですけどがんばりましょう!渡辺も頑張ります.

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